該平臺直接對接人體樣本的RNA二代測序原始數據，具有對數據全自動(dòng)質(zhì)量控制、拼接和病毒組成分析等功能，實(shí)現了快速檢測樣本中可能存在的包括新型冠狀病毒在內的各種病毒，并在線(xiàn)分析其相對載量。
基因組測序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學(xué)證據之一，國家衛健委在對《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第五版)》進(jìn)行解讀時(shí)，還對鑒別診斷要求“單從臨床表現、胸部影像學(xué)難以鑒別，需依靠病原學(xué)檢測來(lái)區分。” 基于基因組分析結果，可精準識別病毒基因特性，監測病毒變異趨勢，在疫情防控、疾病診治、藥物篩選、疫苗設計與藥物研發(fā)等工作中發(fā)揮著(zhù)不可替代的基礎性的作用;也將支撐病毒朔源、變異進(jìn)化、致病機理等研究工作。
VIC平臺實(shí)現了從病毒組基因組測序到基因組拼接與鑒定的“一鍵式”自動(dòng)化服務(wù)，極大簡(jiǎn)化了操作流程。各醫院只需上傳病例原始數據至VIC平臺(見(jiàn)網(wǎng)址)，即可觸發(fā)病毒基因分析流程，并獲得該病例的全基因組分析結果。VIC得到華為云容器平臺強大計算能力的支持，可提供高通量多樣本并行云端分析能力。分析結果不僅能為全面分析患者的呼吸道病毒組，研究其致病因子提供支撐，亦可助力臨床診斷，為采用相應的治療措施提供參考，同時(shí)還可監測病毒變異趨勢，便于提前做出應對措施。
VIC由中國科學(xué)院上海巴斯德研究所大數據平臺設計，由中國科學(xué)院上海營(yíng)養與健康研究所生物醫學(xué)大數據中心開(kāi)發(fā)、運維并提供技術(shù)支撐，由華為云基因容器提供云服務(wù)技術(shù)支撐。VIC平臺只作為一個(gè)計算平臺，所有的數據權利屬于數據提供方，平臺不使用用戶(hù)數據去發(fā)表任何科研論文。在疫情結束前，VIC面向科研用戶(hù)免費開(kāi)放。目前，上海市公共衛生臨床中心，上海交通大學(xué)醫學(xué)院附屬瑞金醫院、中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院作為平臺的首批用戶(hù)，已在VIC上完成了批量新型冠狀病毒肺炎患者樣本的基因組原始測序數據分析。
平臺的服務(wù)網(wǎng)址是http://www.biosino.org/vic/ 和
http://hvic.biosino.org/
聯(lián)系方式：ncov@picb.ac.cn
