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谷歌將開放云平臺:欲破解自閉癥遺傳密碼

2014-12-11 09:50:27   作者:   來源:CTI論壇   評論:0  點擊:


  過去15年來,針對網(wǎng)絡上雜亂無章的信息,谷歌一直在完善其識別技術,F(xiàn)在,該公司將利用這些專業(yè)知識,尋找包含在人類基因組數(shù)據(jù)海洋中有關導致自閉癥的遺傳線索。

  美國自閉癥研究公益組織“自閉癥之聲”(Autism Speaks)周二宣布,該組織正與谷歌合作,對1萬名自閉癥患者及其家庭成員的基因組進行排序。谷歌將存儲和管理這些數(shù)據(jù),并對合格的研究人員開放這些數(shù)據(jù)。在他們尋找可能為自閉癥遺傳根源的變異DNA時,可對這些數(shù)據(jù)進行篩選。

  “自閉癥之聲”首席科學官羅布·林(Rob Ring)表示:“我們認為,理解自閉癥的線索存在于基因組中。我們希望利用與互聯(lián)網(wǎng)搜索類似的技術和方法,對人類的基因組進行搜索,從而尋找這些失蹤的答案。”

  該項目將利用一個名為“谷歌基因組”(Google Genomics)的工具,谷歌幾個月前在其云計算平臺上不聲不響地推出了該工具。

  人類基因組測序的速度變得越來越快,而價格越來越便宜,羅布·林稱,現(xiàn)在完成一次人類基因組測序只要花費2500美元,相比之下,當年的人類基因組計劃(Human Genome Project)花費了近30億美元。這使得研究人員產(chǎn)生的基因數(shù)據(jù)呈天文數(shù)字般地增長。通過允許研究人員將數(shù)據(jù)存儲到其服務器上,谷歌得以顯示和改進其云計算的功能,同時為基因組研究提供了一個潛在的重要服務。

  “谷歌基因組”工程主管、前Google+項目工程主管大衛(wèi)·格雷澤(David Glazer)指出,人類基因組的搜索不是搜索關鍵字,研究人員可以搜索基因組的特定片段及基因組序列,從而找到具有共同變異的基因組片段。因為一個人的基因組可以多達100千兆字節(jié),讓這些數(shù)據(jù)存儲在一個中央服務器中,便于研究人員更容易地開展遠程協(xié)作。

  “自閉癥之聲”總裁利茲·費爾德(Liz Feld)表示,她強烈希望遺傳分析將有助于研究人員推出更加個性化的治療方法,因為基因組分析讓人們對癌癥的不同亞型有更精確的認識。費爾德說:“對我們來說最重要的事情是,這項研究將會讓我們能夠發(fā)現(xiàn)和理解各種形式的自閉癥。”

  自閉癥基因組計劃可能是谷歌首次進軍醫(yī)療和藥品領域。該公司已瞄準從帕金森癥到癌癥所有人類目前尚未攻克的病癥,而它擁有的技術實力讓它有能力開展基因組學研究。近年來,研究人員已經(jīng)看到,生物學有助于人們加深對計算方式的理解。畢竟,大自然已經(jīng)花費了數(shù)十億年的時間完善DNA,讓其作為存儲和傳輸信息的最有效方式。

  羅布·林表示,“自閉癥之聲”自己收集基因組數(shù)據(jù)已超過了10年的時間。他說,現(xiàn)在,他相信谷歌等公司有能力在這方面做一些有價值的事:“我們意識到,我們一些最大的生物學問題是真正的大數(shù)據(jù)問題。”

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